由於細菌及分泌物積存於扁桃體窩導致的。而這些積存的細菌不斷分泌毒素，並經過腺窩周圍的血管網傳播到全身。因而扁桃體成為不少全身性疾病如風濕熱、腎炎等的病灶，這也正是其危害所在。慢性扁桃體炎多由急性扁桃體炎反覆發作轉為慢性。患急性傳染病（如猩紅熱、麻疹、流感、白喉等）後，可引起慢性扁桃體炎，鼻腔有鼻竇感染也可伴發本病。病源菌以鏈球菌及葡萄球菌等最常見。臨床表現為經常咽部不適，異物感，發乾、癢，刺激性咳嗽，口臭等癥狀。
全身癥狀不明顯。局部癥狀主要是咽痛，咽干不適，咽部癢感，口臭等。扁桃體一
慢性扁桃體炎圖解般都比較大。扁桃體隱窩內的細菌素被吸收，而引起身體的變態反應，常有消化不良、頭痛、疲乏無力、低熱等癥狀。檢查時見扁桃體充血，特別咽齶弓充血。有時呈暗紅色，扁桃體表面有瘢痕，凹凸不平，有的有小膿點，擠壓扁桃體可擠豆渣樣分泌物，有時頜下淋巴結腫大。
慢性扁桃體炎（chronic tonsillitis）
多由急性扁桃體炎反覆發作或因隱窩引流不暢，而致扁桃體隱窩及其實質發生慢性炎症病變。也可發生於某些急性傳染病之後。根據免疫學說，扁桃體隱窩內細菌、病毒及代謝產物進入體液後，可引起抗體形成，繼之腺體內產生抗原抗體結合物，能起到一種複合免疫作用，從而認為慢性扁桃體炎是一種自身免疫反應。由於自身抗原抗體結合時對組織細胞有損害，而有利於感染，感染又促進抗原抗體反應，從而形成惡性循環。
主要癥狀是反覆發作急性扁桃體炎。也有部分患者無明顯急性發作史。表現為經常咽部不適，異物感，發乾，癢，刺激性咳嗽，口臭等癥狀。兒童過度肥大的扁桃體可引起呼吸、吞咽、語言障礙。若伴有腺樣體肥大可引起鼻塞、鼾聲及止他性中耳炎癥狀。由於經常咽下分泌物及隱窩中的細菌毒素，可致消化不良，頭痛，乏力、低熱等癥狀。
檢查可見扁桃體慢性充血，扁桃體表面不平，瘢痕，與周圍組織有牽連，有時可見隱窩口封閉，呈黃白色小點，其上蓋有菲薄粘膜或粘連物。隱窩開口處可有膿性分泌物或乾酪樣分泌物，擠壓時分泌物外溢。舌齶弓及咽齶弓充血。下頜淋巴結腫大。
臨床上為記錄方便，可將扁桃體的外形大小分為Ⅲ度：扁桃體超出舌齶弓，但未遮蓋咽齶弓者為Ⅰ度；已遮蓋咽齶弓者為Ⅱ度；超出咽齶弓突向中線者為Ⅲ度。但扁桃體的大小不能作為炎症的指征，因為兒童有生理性肥大，成人多萎縮。
鑒別診斷
本病應與下列疾病相鑒別。
慢性扁桃體炎1.扁桃體角化症（keratosis of tonsil） 為扁桃體隱窩口上皮細胞過度角化，形如黃白色角狀或尖形砂粒樣角化物，觸之堅硬，根基牢固，不能拭掉，可無明顯自覺癥狀，或反覺咽部不適或異物感，可同時發生於咽後壁、咽側束和舌根等處。病程較長，多發生於30歲以前的青年。病因尚不明確，一般不需特殊治療。
2.扁桃體腫瘤 一側扁桃體迅速增大或扁桃體腫大而有潰瘍，均應考慮腫瘤的可能性。如扁桃體肉瘤，早期可局限於扁桃體粘膜下，表面光滑，主要癥狀為一側扁桃體迅速增大，常有頸淋巴結轉移，以青年人較多見，活檢可確診。
3.扁桃體癥狀性肥大 系某些全身性疾病的局部表現，如患白血病時，扁桃體可呈對稱性腫大。有時咽部癥狀可為其首發癥狀。根據周圍血象及骨髓象進行診斷。
併發症
慢性扁桃體炎，不僅由於炎症蔓延可引起鄰近器官的感染，如中耳炎，鼻竇炎，喉、氣管、支氣管炎等，更重要的是為人體常見的感染病灶之一，與急性腎炎、風濕性關節炎、風濕熱、心臟病、長期低熱等疾患關係密切。如何診斷為病灶扁桃體炎，尚缺乏特異性檢查方法。臨床常認為人體受扁桃體隱窩內細菌和毒素的影響，發生變態反應而產生各種併發症；此類併發症多發生於扁桃體炎發作後1～3個月，病情的演變或惡化往往與扁桃體炎的發作有聯繫；病灶性扁桃體以纖維型病變者居多，常有隱窩內分泌物瀦留和頜下淋巴結腫大等，應根據病史、局部與全身檢查等資料，全面分析，相互參證，有時結合扁桃體摘除後的情況加以判斷。另外，扁桃體激發試驗、血清抗鏈球菌溶血素「O」、抗鏈激酶和抗透明質酸酶滴度的動態觀察等，對診斷有一定的參考意義。
慢性扁桃體炎的治療是長期的，堅持治療是很重要的一點。
慢性扁桃體炎保持口腔清潔，每天睡前刷牙，飯後漱口，以減少口腔內細菌感染的機會。
1．西醫藥治療
(1)含漱法：可選用含碘片，每次～2片，每日～4次含化。用淡鹽水漱口，簡單又方便，可於飯後及睡前，取溫開水一杯，加少許食鹽，口感有鹹味即可，反覆漱口，每次5分鐘左右。
(2)藥物治療：可長期服用維生素C，每次片，每日 3次。體質虛弱常易發作者，町在醫生指導下使用提高機體免疫力功能的製劑。非急性發作時，不要濫用消炎葯。
(3)手術治療的選擇：一般可按照以下原則。
①扁桃體過度肥大，妨礙呼吸、吞咽者。
②反覆急性發作，每年～5次以上，有扁桃體周圍膿腫病史。
③長期低熱，全身檢查除扁桃體炎外無其它病變者。
④由於扁桃體炎而導致的腎炎、風：濕等病，應在醫生指導下撣期手術。除此之外，還有一些病人或病情不宜手術者。
①急性炎症期及患急性病、上呼吸道感染和有流行病的時期。
②造血系統疾病、凝血機能減退、高血壓、心臟病、肺結核等病人不宜手術。
③婦女月經期及經前3-5日不做手術，否則，術後咽炎癥狀加重。
④有慢性咽炎的病人如不十分必要可不手術，否則，術後咽炎癥狀加重。至於慢性扁桃體炎的病人具體何時手術為宜，最好請醫生幫助決定。
2．中醫藥治療：中醫認為慢性扁桃體炎與體質虛弱，臟腑虛損有關，主要與肺、腎陰虛有關，治療卜多用滋補肺腎，生津利咽的方法。常用方葯：玄參12克、麥冬10克、生地12克、知母10克、黃柏6克、桔梗10克、生甘草6克。有消化不良，不思飲食者加陳皮10克、砂仁6克、焦三仙各10克。四肢乏力，精神疲倦，大便溏泄者，．則應改服中成藥參苓白朮丸，每次6克，每日2次。
扁桃體炎外用療法
中藥「扁咽消」（原名「扁炎消」）外貼療法
扁咽消使用效果及自測：
慢性扁桃體炎1、觀察扁桃體顏色的變化，是使用扁咽消是否有效的很重要的指標。因為反覆發作的扁桃體炎，即使不急性發作，扁桃體的顏色也是發紅的，在貼葯過程中，會觀察到扁桃體顏色越來越淡。貼夠一定的療程，扁桃體的顏色與口腔粘膜一樣，就說明病灶清除，可停止用藥。
2、觀察扁桃體大小的變化，是貼用扁咽消是否有效的次要指標。因為慢性炎症刺激扁桃體不斷增生、水腫，因此扁桃體炎會出現不同程度的腫大，外貼扁咽消後，可使因炎症造成的水腫消失，增生部分馬上不可能縮小，病灶清除後，會逐漸萎縮。
3、觀察扁桃體伴隨癥狀的變化，是貼用扁咽消是否有效的參考指標。如未貼葯時精神狀態差，食慾不好，睡覺打呼嚕等，在貼葯後癥狀會逐漸減輕直至消失。
1．慢性扁桃體炎的病人應養成良好的生活習慣，保證充足的睡眠時間，隨天氣變化及時增減衣服，去除室內潮濕的空氣，都是重要的。對於患病兒童，應養成不挑食、不過食的良好習慣。
2．堅持鍛煉身體，提高機體抵抗疾病的能力，不過度操勞，若勞累後應及時調整休息。戒除煙酒，是預防慢性扁桃體炎的重要一點。
3．患扁桃體急性炎症應徹底治癒，以免留下後患。
4．預防各類傳染病、流行病。流食或半流食，發熱高者町用酒精擦浴，協助降溫。
2．積極治療急性扁桃體炎可預防本病。
慢性扁桃體炎食療方
(1)肺陰虧虛型，症見咽部干掀不適、微痛、微癢，乾咳無痰或痰少而粘。哽哽不利，喉核肥大、潮紅，連及周圍，喉核上或有黃白色膿點。一般以午後癥狀明顯，並可有午後顴紅，精神疲乏，手足心熱，講話乏力，舌質紅或干、少苔，脈細數等癥狀。治宜養陰清肺，生津潤燥。
(2)腎陰虛損型，症見咽喉干掀不適，微痛，哽哽不利，口乾不喜多飲，喉核及喉核前後潮紅，喉核上或有黃白色膿點。全身並有頭暈眼花，耳鳴，耳聾，腰膝酸軟，虛煩失眠，舌紅少苔，脈細數等症。治宜滋陰降火，清利咽喉。
慢性扁桃體炎
組成：百合15克，去皮香蕉2個，冰糖適量。
用法：上三味加水同炖，服食之。
功效：養陰清肺，生津潤燥。
主治：慢性扁桃體炎，屬肺陰虧虛型，咽部干掀不適，微痛，微癢，於咳無痰或痰少而粘。哽哽不利，喉核肥大，或有黃白色膿點。午後顴紅，手足心熱，講話乏力。
組成：百合20克，桑葉9克。
用法：百合去衣，加桑葉所煎出的汁，合煮為羹，每日食1小碗。
功效：養陰清肺，生津潤燥。
主治：慢性扁桃體炎，屬肺陰虧虛型，咽部於掀不適，微痛，微癢，喉核肥大，潮紅，連及周圍，喉核上或有黃白色膿點。一般以午後癥狀明顯，舌質紅或干少苔。
組成：枸杞30克，豬肉500克。
用法：蘿卜二味加入調料炖湯，佐餐食用。
功效：滋陰降火，清利咽喉。
主治：慢性扁桃體炎，屬腎陰虛損型，咽喉干掀不適，微痛，喉核及喉核前後潮紅，喉核上或有黃白色膿點。頭暈眼花，腰膝酸軟，虛煩失眠。
組成：雪梨100克，甘蔗100克，荸薺100克，藕100克，新鮮蘆根100克。
用法：將上五味榨汁混合，每日飲用，10天為1療程。
功效：滋陰降火，清利咽喉。
主治：慢性扁桃體炎，屬腎陰虛損型，咽喉干掀不適，微痛，哽哽不利，口乾不喜多飲，喉核及喉核前後潮紅，頭暈眼花，耳鳴、耳聾，腰膝酸軟，虛煩失眠。
正常情況下，扁桃體的淋巴細胞和抗體能將病菌消滅或控制住，維持機體的健康。但是，任何防禦的力量都是有限的，當身體抵抗力下降，如在寒冷或潮濕環境、身體過度疲勞、營養不良、缺乏鍛煉等情況下，扁桃體的防禦能力便會減弱；或者當病菌多次侵襲，特別是病菌數量大、毒力強時，扁桃體會因寡不敵眾而被病菌攻破佔領，發生炎症，出現紅腫、疼痛、化膿。輕者低熱、咳嗽，喉部不適；重者高燒不退、呼吸急促，甚至高熱驚厥。
若治療不及時，人體抵抗力不足以戰勝病原體時，炎症就可向周圍組織擴散，並可經血液播散至其他器官，使之發生炎症，還會引起寶寶全身性的病理反應，如繼發風濕熱、風濕性關節炎、風濕性心臟病、急性腎炎和無顯著原因的低熱。當然，像扁桃體周圍膿腫、急性中耳炎、副鼻竇炎等併發症也時有發生。此時，扁桃體便成了寶寶生病的「罪魁禍首」。